3月12日，杨铭宇黄焖鸡米饭被曝出加盟店后厨存在食品安全问题，包括使用存放多天的发酸食物、顾客食用后的剩菜回收再加工售卖、隔夜发黑的牛肉加色素后冒充新鲜牛肉。该消息迅速登上热搜，引发关注。
对此，杨铭宇官微于3月12日发布致歉信，对于近期杨铭宇旗下涉事加盟门店（郑州二七万达店、郑州康复前街店、商丘万鼎广场店）出现的食品安全问题，公司向广大消费者致以最深切的歉意。此次事件暴露出公司在涉事加盟门店的加盟管理、监督执行上的重大漏洞，公司承担全部责任。
致歉信中，该公司表示即日起采取整改行动：
1.涉事加盟门店（郑州二七万达店、郑州康复前街店、商丘万鼎广场店）即刻停业，并且永久关店；
2.全国门店深度排查：组织专项检查组，完成所有门店食材储存、加工流程、环境卫生的彻查，一旦发现有违规门店立即停业追责；
3.全员强化培训与考核：所有员工重新参加食品安全培训并考核，未通过者禁止上岗；
4.监督机制透明化：内部监督小组每月突击检查门店，档案公开可查。
杨铭宇黄焖鸡官网显示，加盟城市超过500个。据南方都市报，截至2024年9月，杨铭宇黄焖鸡米饭在全国拥有2703家门店。
济南杨铭宇餐饮管理有限公司由杨晓路创办于2011年。天眼查App显示，该公司的法定代表人也为杨晓路，注册资本1000万人民币，经营范围含餐饮服务、食品销售等，由杨晓路全资持股。该公司对外投资3家公司，其中2家处于存续状态，分别是山东铭和宇信息科技有限公司、山东杨铭宇供应链科技有限公司。
天眼风险信息显示，曾有多家杨铭宇黄焖鸡米饭店被罚，包括平度市杨铭宇黄焖鸡米饭店、韩城市杨铭宇黄焖鸡米饭店等，被罚事由包括加工间未保持清洁、将厨余垃圾存放到其他垃圾收集容器内、复用餐饮具抽检检验结论为不合格等。
今年1月22日，杨铭宇官方账号曾发文称，董事长杨晓路称食品安全乃是餐饮企业生命线，关乎消费者健康与公司声誉，务必在产品研发、食材采购、操作流程至配送全流程，构建严格食品安全管理体系，确保各环节均达高标准要求。